MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT8_1

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020241	TTG	2	6	98	103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092660
2	NC_020241	T	6	6	114	119	0 %	100 %	0 %	0 %	449092660
3	NC_020241	A	6	6	188	193	100 %	0 %	0 %	0 %	449092660
4	NC_020241	AT	3	6	222	227	50 %	50 %	0 %	0 %	449092660
5	NC_020241	AT	3	6	230	235	50 %	50 %	0 %	0 %	449092660
6	NC_020241	ATG	2	6	258	263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092660
7	NC_020241	TTTA	2	8	325	332	25 %	75 %	0 %	0 %	449092661
8	NC_020241	TC	3	6	367	372	0 %	50 %	0 %	50 %	449092661
9	NC_020241	TTA	2	6	407	412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092661
10	NC_020241	AATA	2	8	488	495	75 %	25 %	0 %	0 %	449092661
11	NC_020241	TTTG	2	8	503	510	0 %	75 %	25 %	0 %	449092661
12	NC_020241	T	6	6	522	527	0 %	100 %	0 %	0 %	449092661
13	NC_020241	ATA	2	6	916	921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092662
14	NC_020241	TAA	2	6	965	970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092662
15	NC_020241	TCT	2	6	993	998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092662
16	NC_020241	AT	3	6	1064	1069	50 %	50 %	0 %	0 %	449092662
17	NC_020241	GAT	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092662
18	NC_020241	AAT	2	6	1090	1095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092662
19	NC_020241	TAG	2	6	1334	1339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092663
20	NC_020241	ATT	2	6	1601	1606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092664
21	NC_020241	ATT	2	6	1641	1646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092664
22	NC_020241	AAC	2	6	1686	1691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092664
23	NC_020241	AGA	3	9	1694	1702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092664
24	NC_020241	TAT	2	6	1719	1724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092664
25	NC_020241	A	6	6	1789	1794	100 %	0 %	0 %	0 %	449092664
26	NC_020241	AC	3	6	1811	1816	50 %	0 %	0 %	50 %	449092664
27	NC_020241	T	6	6	1823	1828	0 %	100 %	0 %	0 %	449092664
28	NC_020241	TAT	2	6	1836	1841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092664
29	NC_020241	GCAT	2	8	1855	1862	25 %	25 %	25 %	25 %	449092664
30	NC_020241	AGA	2	6	1925	1930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092664
31	NC_020241	TGA	2	6	1937	1942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092664
32	NC_020241	TAT	2	6	1983	1988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092664
33	NC_020241	TCA	2	6	1994	1999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092664
34	NC_020241	TTA	2	6	2004	2009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092664
35	NC_020241	T	7	7	2039	2045	0 %	100 %	0 %	0 %	449092664
36	NC_020241	AC	3	6	2089	2094	50 %	0 %	0 %	50 %	449092664
37	NC_020241	AGA	2	6	2135	2140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092664
38	NC_020241	TAA	2	6	2159	2164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092664
39	NC_020241	TCT	2	6	2264	2269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092664
40	NC_020241	AAG	2	6	2287	2292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092664
41	NC_020241	TTA	2	6	2313	2318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092664
42	NC_020241	ACAA	2	8	2342	2349	75 %	0 %	0 %	25 %	449092664
43	NC_020241	AT	3	6	2363	2368	50 %	50 %	0 %	0 %	449092664
44	NC_020241	ATAC	2	8	2513	2520	50 %	25 %	0 %	25 %	449092664
45	NC_020241	GAA	2	6	2532	2537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092664
46	NC_020241	GAA	2	6	2556	2561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092664
47	NC_020241	TTA	2	6	2619	2624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092664
48	NC_020241	ATG	2	6	2642	2647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092664
49	NC_020241	A	6	6	2648	2653	100 %	0 %	0 %	0 %	449092665
50	NC_020241	ACA	2	6	2684	2689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092665
51	NC_020241	TTTTC	2	10	2694	2703	0 %	80 %	0 %	20 %	449092665
52	NC_020241	AAT	2	6	2711	2716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092665
53	NC_020241	ATG	2	6	2730	2735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092665
54	NC_020241	A	7	7	2742	2748	100 %	0 %	0 %	0 %	449092665
55	NC_020241	ATT	2	6	2753	2758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092665
56	NC_020241	CAA	2	6	2759	2764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092665
57	NC_020241	AAT	2	6	2881	2886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092666
58	NC_020241	A	7	7	2911	2917	100 %	0 %	0 %	0 %	449092666
59	NC_020241	GA	3	6	2926	2931	50 %	0 %	50 %	0 %	449092666
60	NC_020241	A	7	7	2953	2959	100 %	0 %	0 %	0 %	449092666
61	NC_020241	GGA	2	6	2980	2985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449092666
62	NC_020241	AAT	2	6	3016	3021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092666
63	NC_020241	AAC	2	6	3043	3048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092666
64	NC_020241	ATA	2	6	3052	3057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092666
65	NC_020241	TC	3	6	3070	3075	0 %	50 %	0 %	50 %	449092666
66	NC_020241	GAA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092666
67	NC_020241	TA	4	8	3147	3154	50 %	50 %	0 %	0 %	449092666
68	NC_020241	TTG	2	6	3170	3175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092666
69	NC_020241	TAA	2	6	3186	3191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092666
70	NC_020241	ATG	2	6	3212	3217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092666
71	NC_020241	ACA	2	6	3237	3242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092666
72	NC_020241	A	6	6	3247	3252	100 %	0 %	0 %	0 %	449092666
73	NC_020241	T	6	6	3313	3318	0 %	100 %	0 %	0 %	449092666
74	NC_020241	TGG	2	6	3348	3353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092666
75	NC_020241	A	6	6	3373	3378	100 %	0 %	0 %	0 %	449092666
76	NC_020241	AAG	2	6	3386	3391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092666
77	NC_020241	GTAGC	2	10	3425	3434	20 %	20 %	40 %	20 %	449092666
78	NC_020241	TTA	2	6	3456	3461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092666
79	NC_020241	TATTT	3	15	3512	3526	20 %	80 %	0 %	0 %	449092667
80	NC_020241	AT	3	6	3595	3600	50 %	50 %	0 %	0 %	449092667
81	NC_020241	ATT	2	6	3614	3619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092667
82	NC_020241	TAG	2	6	3633	3638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092667
83	NC_020241	A	8	8	3665	3672	100 %	0 %	0 %	0 %	449092667
84	NC_020241	A	6	6	3933	3938	100 %	0 %	0 %	0 %	449092668
85	NC_020241	T	7	7	3949	3955	0 %	100 %	0 %	0 %	449092668
86	NC_020241	TTG	2	6	4543	4548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092670
87	NC_020241	TAG	2	6	4577	4582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092670
88	NC_020241	A	7	7	4586	4592	100 %	0 %	0 %	0 %	449092670
89	NC_020241	GTG	2	6	4646	4651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092670
90	NC_020241	T	8	8	4923	4930	0 %	100 %	0 %	0 %	449092671
91	NC_020241	CGG	2	6	4949	4954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449092671
92	NC_020241	GA	3	6	5093	5098	50 %	0 %	50 %	0 %	449092672
93	NC_020241	AAAG	2	8	5133	5140	75 %	0 %	25 %	0 %	449092672
94	NC_020241	ATT	2	6	5157	5162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092672
95	NC_020241	AATT	2	8	5224	5231	50 %	50 %	0 %	0 %	449092672
96	NC_020241	TGT	2	6	5285	5290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092672
97	NC_020241	TTG	2	6	5291	5296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092672
98	NC_020241	T	6	6	5381	5386	0 %	100 %	0 %	0 %	449092672
99	NC_020241	GAGAA	2	10	5401	5410	60 %	0 %	40 %	0 %	449092672
100	NC_020241	TGA	2	6	5435	5440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092672
101	NC_020241	A	6	6	5440	5445	100 %	0 %	0 %	0 %	449092672
102	NC_020241	AAAAAC	2	12	5482	5493	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	449092672
103	NC_020241	T	6	6	5508	5513	0 %	100 %	0 %	0 %	449092672
104	NC_020241	GAAA	2	8	5564	5571	75 %	0 %	25 %	0 %	449092672
105	NC_020241	GTG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092672
106	NC_020241	ACA	2	6	5648	5653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092672
107	NC_020241	AGA	2	6	5660	5665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092672
108	NC_020241	AAGAA	2	10	5674	5683	80 %	0 %	20 %	0 %	449092672
109	NC_020241	ATAG	2	8	5688	5695	50 %	25 %	25 %	0 %	449092672
110	NC_020241	GTC	2	6	5837	5842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449092672
111	NC_020241	AGA	2	6	5855	5860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092672
112	NC_020241	AG	3	6	5919	5924	50 %	0 %	50 %	0 %	449092672
113	NC_020241	AG	3	6	5961	5966	50 %	0 %	50 %	0 %	449092672
114	NC_020241	GAAG	2	8	5978	5985	50 %	0 %	50 %	0 %	449092672
115	NC_020241	TGA	3	9	6131	6139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092672
116	NC_020241	GAA	2	6	6183	6188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092672
117	NC_020241	CAA	2	6	6189	6194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092672
118	NC_020241	GA	3	6	6249	6254	50 %	0 %	50 %	0 %	449092672
119	NC_020241	A	9	9	6545	6553	100 %	0 %	0 %	0 %	449092673
120	NC_020241	GAG	2	6	6621	6626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449092673
121	NC_020241	A	7	7	6634	6640	100 %	0 %	0 %	0 %	449092673
122	NC_020241	T	6	6	6655	6660	0 %	100 %	0 %	0 %	449092673
123	NC_020241	AGA	2	6	6809	6814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092674
124	NC_020241	TGAG	2	8	6818	6825	25 %	25 %	50 %	0 %	449092674
125	NC_020241	AGA	3	9	6890	6898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092674
126	NC_020241	GGA	2	6	6950	6955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449092674
127	NC_020241	GAT	2	6	6987	6992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092674
128	NC_020241	AAAG	2	8	7014	7021	75 %	0 %	25 %	0 %	449092674
129	NC_020241	T	7	7	7028	7034	0 %	100 %	0 %	0 %	449092674
130	NC_020241	GAC	2	6	7041	7046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449092674
131	NC_020241	TAA	2	6	7092	7097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092674
132	NC_020241	TCA	2	6	7190	7195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092674
133	NC_020241	GAA	2	6	7198	7203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092674
134	NC_020241	AAC	2	6	7210	7215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092674
135	NC_020241	ATT	2	6	7325	7330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092674
136	NC_020241	AAG	2	6	7358	7363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092674
137	NC_020241	AAG	2	6	7508	7513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092674
138	NC_020241	GTC	2	6	7544	7549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449092674
139	NC_020241	AATT	2	8	7550	7557	50 %	50 %	0 %	0 %	449092674
140	NC_020241	ATT	2	6	7569	7574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092674
141	NC_020241	A	6	6	7588	7593	100 %	0 %	0 %	0 %	449092674
142	NC_020241	GAAT	2	8	7635	7642	50 %	25 %	25 %	0 %	449092674
143	NC_020241	ATT	2	6	7643	7648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092674
144	NC_020241	TAAT	2	8	7745	7752	50 %	50 %	0 %	0 %	449092674
145	NC_020241	TAT	3	9	7798	7806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092675
146	NC_020241	A	6	6	7838	7843	100 %	0 %	0 %	0 %	449092675
147	NC_020241	A	7	7	7900	7906	100 %	0 %	0 %	0 %	449092675
148	NC_020241	ATT	2	6	7912	7917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092675
149	NC_020241	GTTG	2	8	7974	7981	0 %	50 %	50 %	0 %	449092675

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.